При банкротстве индивидуального предпринимателя действуют все положения закона о банкротсве физических лиц, относящиеся к гражданину не являющимся предпринимателем. Подсудность. Дела о банкротстве предпринимателей рассматриваются в арбитражном суде, физических лиц не являющихся предпринимателями в районном суде. Имеет значение и откуда возникли долги. Если от предпринимательской деятельности, то арбитраж. Причем этом не важно имеет ли человек статус предпринимателя  в данный момент. Все равно арбитражный суд.
Если, кроме долгов от предпринимательской деятельности у ИП есть еще и долги физического лица - кредиты получены и не возвращены (как физлицо), то эти долги суммируются с предпринимательскими. Все долги по окончании банкротства предпринимателя списываются полностью, включая и те которые он получил как физлицо.

Статья 6. Рассмотрение дел о банкротстве
1. Дела о банкротстве юридических лиц, индивидуальных предпринимателей, а также дела о банкротстве граждан, которые прекратили деятельность в качестве индивидуального предпринимателя, но денежные обязательства и (или) обязанность по уплате обязательных платежей которых возникли в результате осуществления ими предпринимательской деятельности, рассматриваются арбитражным судом.
Дела о банкротстве граждан, не являющихся индивидуальными предпринимателями, за исключением указанных в абзаце первом настоящего пункта граждан, рассматриваются судом общей юрисдикции.